在府城战事结束的同时，台湾北部义军进展神，淡水守备董得魁只身逃亡后，义军一路南下，顺顺利利的荡平了北部所有清廷的势力，基隆港等地尽归义军所有。()这样，台湾全岛挣脱了清廷的控制。
1795年11月12日，在各路义军的拥护下，十岁的朱昂正式继位，国号“明”，以府城为临时首都，宣布明年即1796年为“光明”元年，封夏雯为“护国大将军”，相当于总司令，负责全台军务。一个20多岁的女子成了军队头头，当然有不少人不服气甚至起了疑心，不过当“夷目”爱娜明确表示支持夏雯后，义军大小头目都闭嘴了——盐埕桥一战，夷兵的火炮大出风头，这就是实力！
此外孔子明担任了吏部尚书和户部尚书等职，又吸收了一批文人和投降的清廷文官，负责处理内政；吴大田等义军头领都获得了一系列官职，算是享受了胜利果实。
11月13日，上任后第二天，孔子明就发布了农业政策：按农田肥薄册所记田赋，分为三级，每级又分为三等，共为九等。所教税赋以农田为计，百姓圈养牲畜不论。百姓可按市价以米粮充值，或缴纳银钱。取消原先清廷官府的一系列苛捐杂税，规定拥有土地的最高限额。
商业政策就简单多了，爱莲娜代表艾诺斯公司，孔子明代表新生的”明国“，签署了通商条约，规定台湾的茶叶，樟脑，红糖等商品只许卖给艾诺斯公司，而艾诺斯公司将会对明国提供军火，并获得驻军的权利。
当条约签订的时候，澎湖还在两千清军手中。()水师副将蔡龙很郁闷，台湾在一个多月里就变天了，而自己并未接到任何命令，只好等着，等了近两个月，终于等来了蔡牵，都姓蔡，五百年前是一家，于是蔡龙很干脆的投降了，全体官兵剪了辫子，继续驻守澎湖。
”孔先生，干杯！“玻璃酒杯碰撞在一起，发出好听的声音。孔子明没想到，海克大人的女儿竟然这么神奇，而自己潜伏台湾两年后，终于再次喝上葡萄酒，心情大好。
”孔先生，您现在也是大官了，恭喜恭喜啊！“爱娜抱拳作揖。
”哈哈哈....“孔子明不禁洋洋得意，几年前自己还是个酸秀才，真是”王侯将相宁有种乎“，自己也会有出将入相的一天，虽然只限于台湾孤岛。
等对方平复下来，爱娜提出了”练新军“的问题：如今台湾人口有160万，装备一支3万人的”洋枪队“不成问题。
对于爱娜的设想，见识过火器厉害的孔子明连连点头，但也提醒道”如今台湾刚刚经历战火，至少要经过半年的恢复，购买枪炮的费用.........恐怕拿不出来啊..........“
”那可以分期支付啊！“爱娜很快就想到了办法，”为了我们的友谊，利息就免了。“
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台湾沦陷，援军惨败的事实令闽浙总督杨斯伦胆战心惊：台湾乃是孤岛，民众皆是移民后裔，本就民风彪悍，乡间挣扰纷多，台澎镇也是自己下辖十三镇中唯一一个三年轮换的镇营，以一镇之力竟然平定不了民乱，那事情就大了。
叹了一口气，杨斯伦急命人招来福建巡抚徐嗣曾，按察使李永祺、布政使伍位纳觉罗氏和水师提督黄仕简以及福建将军恒瑞。
”如今全台俱陷，逆匪猖獗，公然打出反清复明的旗号........“杨斯伦的话有气无力。几位下属的脸上都能挂下一层霜来。杨斯伦轻咳了一下，待众人抬起头来这才说道：“此事关系重大，我等还需即快拿定主意，另外上报皇上的折子……”说到这顿了顿，他是真的感到为难，“老夫自会斟酌，众位放宽心就是了，不过这议罪银……”
“大人放心，这次的议罪银我等同出。”恒瑞赶紧接道，“本人愿出白银一万两，用来赎罪。”
恒瑞的话音一落，这边的徐嗣曾就接上了，“就是，就是，下官也愿出银万两。”他也是到福建不久，还不到一年，跟脚扎的不深，面对自己的顶头上司自然不敢懈怠。
接着其他人纷纷附和，一副替上司分忧的模样，让老总督感动不已：自己不用出钱了。
胜败乃兵家常事，此前张见升的失败，并没有让杨斯伦彻底泄气，第二天，他命水师提督黄仕简领兵二千名自鹿耳门登陆，副将丁朝雄从海坛镇总兵郝壮猷自淡水登岸，都司马元勋屯鹿仔港，分道部署；又调拨了一千多绿营兵作为支援。
同时，杨斯伦的奏折也上路了，六百里加急，送往北京。回到总督府，杨斯伦就紧张的等待消息，他希望能在乾隆看到奏折做出批示前，就扫平台湾逆匪，然而...........
11月18日，三支清军水师离开厦门港不久，还没来得急分路进剿，就被打着“明国水师”旗号的夷船一锅端了，“片帆不留”。坏消息传来，可怜的杨斯伦一下晕倒了。
12月2日，闽浙总督杨斯伦呈报台湾天地会乱党起事的奏折和福建三位主官的议罪银折子，一路快马加急，终于送到85岁的乾隆面前。
此时的乾隆心情不错，平定西南地区的苗民起事有了阶段性成果——首犯吴八月被俘。乾隆已经下令，重重嘉奖福康安和和琳。
看完了杨斯伦的奏折，乾隆先是眉头一皱：搞什么名堂？再过两个月，自己就要退位了，到了年底还生乱子！但看了议罪银折子后，乾隆心情逐渐好了起来：上面写着每人愿缴纳议罪银万两。乾隆转眼想到：台湾乃外化之地，刁民难免闹出事端来，也不足为怪，平了就是了。他记得很清楚，康熙三十五年台湾就出了个叫朱一贵的乱民，7年前又出了一个林爽文的刁民，最后不都被镇压了吗？
又仔细看了看奏折，乾隆不禁莞尔：原来这次作乱的，是朱一贵的后人朱昂啊！心道：呵呵，你祖宗都被我灭了，你能蹦跶几天？
然而乾隆不知道，杨斯伦隐瞒了夷人参与叛乱的消息。一是因为夷船飘忽不定，杨斯伦到现在都不知道是哪国夷人，二是因为厦门一战惨败，杨斯伦不敢上报吃了败仗。